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中国首个国家基因库开始运营

重庆新闻网  2016-09-22 来源: 重庆新闻网  
 

  中国首个国家基因库——深圳国家基因库9月22日开始正式运营。这个依托深圳华大基因研究院组建的国家级基因库,目前已存储多种生物资源样本超过1000万份。

  中国的国家基因库位于深圳市大鹏新区观音山脚下,一期占地面积4.75万平方米,里面建有基因测序房、超级计算房以及冷冻资源房。而它的规模更体现在它的内容上。它由三个库和两个平台组成:三个库分别是用来存储和管理中国特有遗传资源的生物资源样本库,目前已存储多种生物资源样本1000万份;生物信息数据库,目前它可检索条目数已经超过一个亿;生物活体库,中国希望把它打造成为中国的诺亚方舟,保护和保存世界约三十万种植物、百万种动物、近千万种微生物活体资源。两个平台是数字化平台和合成与编辑平台,主要是用来处理数据。这个基因库现在号称是全球最大的综合性基因库。

  深圳国家基因库就是要把全球的生物资源都收集起来,用测序仪读取万物的遗传数据,用超级计算机算出结果,用合成与编辑平台写出生命代码,最后再用来为人类服务。中国的这艘“诺亚方舟”,和其他国家的基因库一样,承载着人类及其他生物的遗传样本和密码。中国也需要这样一个平台,从国家层面对具有中国特色的生物样本和基因数据进行有效保存、管理和合理利用。

  在这之前,美国、欧洲、日本都已经建立了大型基因数据库,这三大库里的生物信息数据几乎涵盖所有已知的脱氧核糖核酸、核糖核酸和蛋白质数据。中国国家基因库与这三大库的不同就在于,它不仅仅是数据库,而是国际上现有的各类生物样本库、数据库、生物多样性库、疾病库等的综合升级版。除了基因、蛋白、分子、影像等多组学生物信息数据库,也就是所谓的“干库”和多样性生物样本和物种遗传资源库,也就是所谓的“湿库”之外,中国的国家基因库还引入了“活库”,也就是生物活体库,将存储的内容扩展到动物资源、植物资源、微生物资源和海洋资源。同时,该基因库不仅面向科研,还面向推动中国精准医学、精准农业的发展,把对基因的利用用于推动产业发展。

  深圳国家基因库也是一个开放的平台。目前,中国国家基因库已与联合国粮食及农业组织、国际农业研究磋商小组、国际生物及环境样本库协会、挪威斯瓦尔巴全球种子库、美国自然历史博物馆等100多个组织和科研机构建立战略合作关系,在人类健康、生物多样性、生物进化机制等方面开展合作研究。

  据介绍,目前深圳国家基因库已建成20PB数据的可访问能力。以一部电影约500MB计算,20PB相当于四千万部电影,一个人一天看一部电影,至少需要10万年才能看完。

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